2015年起，他指使下属采取虚构工程项目的方式，伪造工程合同及验收报告，并令人冒用他人身份先后注册成立了两家“皮包”公司，专门用于虚开建筑类发票，总共套取财政和扶贫发展专项资金518万余元，其中扶贫资金90余万元。在套取资金的同时，他还以乡财政资金困难为由，13次从乡代理办违规挪用村级集体资金和村民互助资金435.2万元，其中最多一次，挪用资金高达80万元。

2008年1月，元瑞公司成立，注册资金1200万，全部由余科建出资，其占60%股份，并未出资的邓伟年、莫定发和司机李某，各占了20%、15%和5%的股份。后来，经过两次增资，公司股本金增加至8200万，仍旧全由余科建出钱，持股比例不变。后经法院认定，邓伟年收受的股份价值1440万元。

《国办印发《意见》:促进养老托育服务健康发展》他还表示，中国的市场需求导向已经从低附加价值产品变成了高附加价值产品，跨国公司必须要重视这一变化。